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L’Unità Funzionale Trapianto Allogenico esegue trapianti mieloablativi e a condizionamento ridotto, sia da donatori famigliari che da registro, in pazienti con patologie oncoematologiche e con tumori solidi. Dal 2002 è in atto una collaborazione con il Fred Hutchinson Cancer Research Center a Seattle, con scambio di personale medico e condivisione di protocolli di ricerca e clinica.